| P | Mannschaft | Jahre | Spiele | S | U | N | Tore | Diff | Punkte |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | Werder Bremen II | 14 | 486 | 205 | 114 | 167 | 804 : 657 | +147 | 729 : 615 |
| 2 | VfB Lübeck | 12 | 418 | 205 | 94 | 119 | 714 : 499 | +215 | 709 : 451 |
| 3 | VfL Osnabrück | 11 | 380 | 193 | 109 | 78 | 660 : 395 | +265 | 688 : 343 |
| 4 | Eintr. Braunschweig | 11 | 380 | 197 | 96 | 87 | 677 : 397 | +280 | 687 : 357 |
| 5 | Hamburger SV II | 14 | 484 | 171 | 116 | 197 | 644 : 706 | -62 | 629 : 707 |
| 6 | Holstein Kiel | 11 | 380 | 144 | 101 | 135 | 540 : 538 | +2 | 533 : 506 |
| 7 | Wilhelmshaven | 10 | 344 | 120 | 85 | 139 | 485 : 530 | -45 | 445 : 502 |
| 8 | Kickers Emden | 8 | 278 | 107 | 74 | 97 | 398 : 395 | +3 | 395 : 365 |
| 9 | Rot-Weiß Essen | 6 | 210 | 107 | 51 | 52 | 345 : 216 | +129 | 371 : 207 |
| 10 | Chemnitzer FC | 7 | 242 | 84 | 53 | 105 | 307 : 336 | -29 | 305 : 368 |
| 11 | Fortuna Düsseldorf | 6 | 214 | 83 | 52 | 79 | 289 : 274 | +15 | 301 : 289 |
| 12 | Wuppertaler SV | 5 | 178 | 79 | 45 | 54 | 256 : 226 | +30 | 282 : 207 |
| 13 | TUS Celle | 6 | 204 | 77 | 50 | 77 | 307 : 334 | -27 | 281 : 281 |
| 14 | SV Babelsberg 03 | 5 | 174 | 76 | 48 | 50 | 244 : 210 | +34 | 276 : 198 |
| 15 | Preußen Münster | 6 | 210 | 74 | 49 | 87 | 289 : 325 | -36 | 271 : 310 |
| 16 | 1. FC Magdeburg | 5 | 174 | 72 | 50 | 52 | 252 : 206 | +46 | 266 : 206 |
| 17 | Bor. Dortmund II | 6 | 212 | 67 | 59 | 86 | 270 : 301 | -31 | 260 : 317 |
| 18 | Lüneburger SK | 6 | 206 | 68 | 53 | 85 | 294 : 313 | -19 | 257 : 308 |
| 19 | VfB Oldenburg | 5 | 170 | 68 | 42 | 60 | 261 : 264 | -3 | 246 : 222 |
| 20 | Wattenscheid 09 | 5 | 174 | 66 | 43 | 65 | 296 : 291 | +5 | 241 : 238 |
| 21 | Dynamo Dresden | 4 | 140 | 62 | 39 | 39 | 184 : 144 | +40 | 225 : 156 |
| 22 | FC St. Pauli | 4 | 142 | 59 | 43 | 40 | 192 : 149 | +43 | 220 : 163 |
| 23 | SC Paderborn 07 | 4 | 138 | 61 | 36 | 41 | 228 : 189 | +39 | 219 : 159 |
| 24 | Hertha BSC II | 5 | 176 | 58 | 45 | 73 | 237 : 266 | -29 | 216 : 264 |
| 25 | 1. FC Union Berlin | 4 | 144 | 57 | 37 | 50 | 206 : 161 | +45 | 208 : 187 |
| 26 | VfL Herzlake | 5 | 170 | 54 | 46 | 70 | 230 : 295 | -65 | 208 : 256 |
| 27 | SC Norderstedt | 5 | 170 | 54 | 41 | 75 | 226 : 266 | -40 | 203 : 266 |
| 28 | KFC Uerdingen 05 | 5 | 174 | 67 | 40 | 67 | 231 : 252 | -21 | 192 : 241 |
| 29 | VfL Wolfsburg II | 4 | 140 | 48 | 35 | 57 | 170 : 194 | -24 | 178 : 206 |
| 30 | Hannover 96 | 2 | 68 | 54 | 10 | 4 | 225 : 54 | +171 | 172 : 22 |
| 31 | SC Verl | 4 | 140 | 48 | 28 | 64 | 189 : 227 | -38 | 172 : 220 |
| 32 | FC Erzgebirge Aue | 3 | 104 | 49 | 21 | 34 | 145 : 125 | +20 | 168 : 123 |
| 33 | Bayer Leverkusen II | 4 | 140 | 44 | 28 | 68 | 195 : 240 | -45 | 160 : 232 |
| 34 | 1. FC Köln II | 4 | 140 | 40 | 38 | 62 | 202 : 247 | -45 | 158 : 224 |
| 35 | Rot-Weiß Erfurt | 3 | 108 | 39 | 31 | 38 | 151 : 138 | +13 | 148 : 145 |
| 36 | FC St. Pauli II | 4 | 136 | 35 | 37 | 64 | 157 : 253 | -96 | 142 : 229 |
| 37 | SV Arminia Hannover | 3 | 102 | 38 | 26 | 38 | 155 : 138 | +17 | 140 : 140 |
| 38 | BV Cloppenburg | 3 | 102 | 37 | 25 | 40 | 170 : 172 | -2 | 136 : 145 |
| 39 | Göttingen 05 | 4 | 136 | 32 | 38 | 66 | 160 : 259 | -99 | 134 : 236 |
| 40 | Eintracht Nordhorn | 3 | 102 | 36 | 20 | 46 | 159 : 192 | -33 | 128 : 158 |
| 41 | Hallescher FC | 2 | 68 | 33 | 27 | 8 | 90 : 45 | +45 | 126 : 51 |
| 42 | VfL 93 Hamburg | 3 | 102 | 29 | 29 | 44 | 120 : 168 | -48 | 116 : 161 |
| 43 | Rot-Weiß Ahlen | 2 | 72 | 32 | 19 | 21 | 121 : 93 | +28 | 115 : 82 |
| 44 | Concordia Hamburg | 3 | 102 | 28 | 29 | 45 | 120 : 149 | -29 | 113 : 164 |
| 45 | Dresdner SC 98 | 3 | 104 | 29 | 23 | 52 | 111 : 159 | -48 | 110 : 179 |
| 46 | SV Lurup Hamburg | 3 | 102 | 27 | 28 | 47 | 130 : 171 | -41 | 109 : 169 |
| 47 | Rot-Weiß Oberhausen | 2 | 72 | 29 | 18 | 25 | 94 : 85 | +9 | 105 : 93 |
| 48 | Hannover 96 II | 3 | 68 | 27 | 17 | 24 | 110 : 83 | +27 | 98 : 89 |
| 49 | Sportfreunde Ricklingen | 3 | 102 | 26 | 20 | 56 | 109 : 189 | -80 | 98 : 188 |
| 50 | Atlas Delmenhorst | 3 | 102 | 23 | 26 | 53 | 127 : 194 | -67 | 95 : 185 |
| 51 | Sachsen Leipzig | 3 | 104 | 20 | 33 | 51 | 97 : 153 | -56 | 93 : 186 |
| 52 | VFC Plauen | 2 | 68 | 24 | 20 | 24 | 101 : 93 | +8 | 92 : 92 |
| 53 | Fortuna Köln | 1 | 70 | 24 | 16 | 30 | 91 : 110 | -19 | 88 : 106 |
| 54 | SV Meppen | 2 | 68 | 23 | 17 | 28 | 99 : 103 | -4 | 86 : 101 |
| 55 | Hansa Rostock II | 2 | 68 | 23 | 14 | 31 | 89 : 119 | -30 | 83 : 107 |
| 56 | Türkiyemspor Berlin | 2 | 68 | 22 | 15 | 31 | 87 : 107 | -20 | 81 : 108 |
| 57 | FC Oberneuland | 2 | 68 | 21 | 14 | 33 | 77 : 112 | -35 | 77 : 113 |
| 58 | Carl Zeiss Jena | 1 | 36 | 22 | 6 | 8 | 58 : 32 | +26 | 72 : 30 |
| 59 | FC Energie Cottbus II | 2 | 70 | 17 | 16 | 37 | 54 : 97 | -43 | 67 : 127 |
| 60 | Altona 93 | 2 | 68 | 15 | 16 | 37 | 73 : 134 | -61 | 61 : 127 |
| 61 | FC Bremerhaven | 2 | 68 | 16 | 13 | 39 | 78 : 149 | -71 | 61 : 130 |
| 62 | Tennis Borussia Berlin | 2 | 70 | 14 | 15 | 41 | 66 : 135 | -69 | 57 : 138 |
| 63 | ZFC Meuselwitz | 1 | 34 | 10 | 13 | 11 | 40 : 50 | -10 | 43 : 46 |
| 64 | Schalke 04 II | 1 | 34 | 10 | 8 | 16 | 54 : 70 | -16 | 38 : 56 |
| 65 | Bor. M'gladbach II | 1 | 36 | 9 | 8 | 19 | 45 : 62 | -17 | 35 : 65 |
| 66 | Arminia Bielefeld II | 1 | 36 | 7 | 8 | 21 | 50 : 89 | -39 | 28 : 71 |
| 67 | VfR Neumünster | 1 | 34 | 4 | 11 | 19 | 32 : 65 | -33 | 23 : 68 |
| 68 | Goslarer SC | 1 | 34 | 4 | 8 | 22 | 33 : 67 | -34 | 20 : 74 |
| 69 | TuS Hoisdorf | 1 | 34 | 4 | 3 | 27 | 26 : 83 | -57 | 15 : 84 |
| Die Tabelle wurde nach dem 3-Punkte-System errechnet und beinhaltet folgende Änderungen: 2001/02 wurden Rot-Weiß Essen 1 Punkt abgezogen 2004/05 wurden dem VfL Wolfsburg II 1 Punkt abgezogen 2004/05 wurden Hertha BSC II 3 Punkte abgezogen und nur 2 von 6 Toren gewertet 2004/05 wurde dem KFC Uerdingen die Lizenz entzogen und alle (49) Punkte abgezogen |